Narcisse instances

Pan Troglodyte
Human and Chimp: Can Our Genes Tell the Story of Our Divergence? - Credits

Animals

(27 species)

Bacillus subtilis. © Rut Carballido-Lopez.
Bacillus subtilis. © Rut Carballido-Lopez.

Bacteria

(81 species)


Microscopie électronique à balayage. Flore de surface d'un camembert de fabrication traditionnelle. Levures. G=4500. © Micheline Rousseau;
Microscopie électronique à balayage. Flore de surface d'un camembert de fabrication traditionnelle. Levures. G=4500. © Micheline Rousseau;

Fungi

(24 species)

Grappes de raisin en cours de maturation. © Anne-Sophie Walker.
Grappes de raisin en cours de maturation. © Anne-Sophie Walker.

Plants

(47 species)

In French Qu'est-ce que Narcisse ?

Narcisse est un navigateur de génomes comparés. L'objectif est de fournir un accès simple et intuitif aux résultats de comparaison de génomes entièrement ou partiellement séquencés. Le principe de construction des segments conservés repose sur l'idée que la notion de conservation dépend du niveau de résolution. Au niveau chromosomique, c'est la conservation des synténies (larges régions chromosomiques dont le contenu en gènes est identique dans les deux espèces) qui est pertinente alors qu'à un niveau élevé de résolution c'est la conservation des séquences, reflétée par la possibilité de les aligner, qui présente un intérêt. Le nombre de niveaux de conservation est fixé, de manière plus ou moins arbitraire à 5 pour les animaux et à 2 pour les autres règnes. Le logiciel Narcisse permet de naviguer entre ces niveaux de conservation.


All pages generated by Narcisse are Valid XHTML 1.0 Strict
Valid XHTML 1.0 Strict

Licensing

© INRA/CNRS - The Narcisse software is governed by the CeCILL v2 license

Installing Narcisse at home !

Narcisse can be downloaded and installed at your lab
download Narcisse

Credits

INRA, CNRS and others...
Directeur de publication: Thomas Faraut  
Administrateur:
Emmanuel Courcelle

Browser compatibility

Narcisse needs a css 2.1 compatible browser, and javascript must be enabled. Narcisse does not use any cookie. Narcisse has been extensively tested with Firefox 3.5, but it should work with the following browsers:

Getting Help in Narcisse

Need an advice ? Want to share your Narcisse expertise ? Please subscribe to the Narcisse diffusion list
click here to subscribe
If already a subscriber, you may send an email to the list

How to cite Narcisse ?

If using Narcisse, Please cite the following reference in your publication:
"Narcisse: a mirror view of conserved syntenies
Emmanuel Courcelle; Yoann Beausse; Sebastien Letort; Olivier Stahl; Romain Fremez; Catherine Ngom-Bru; Jerome Gouzy; Thomas Faraut -  Nucleic Acids Research 2008 Jan;36(Database issue):D485-90."
Full text free access