Arriving soon... the 2.0 release of Narcisse

Narcisse instances

Human and Chimp: Can Our Genes Tell the Story of Our Divergence? - Credits

animals

(21 species)

Bacterial cells of Staphylococcus aureus, one of the causal agents of mastitis in dairy cows. Magnified 50,000X. - Credits

bacteria

(853 species)

Candida albicans. 'Germ tube' formation by 3 hours incubation in calf serum at 37C. magnification:600 - Credits

Arabidopsis thaliana is a small flowering plant, widely used as a model organism in plant biology. It is a member of the mustard (Brassicaceae) family, which includes cultivated species such as cabbage and radish. Credits

plants

(12 species)

Qu'est-ce que Narcisse ?

Narcisse est un navigateur de génomes comparés. L'objectif est de fournir un accès simple et intuitif aux résultats de comparaison de génomes entièrement ou partiellement séquencés. Le principe de construction des segments conservés repose sur l'idée que la notion de conservation dépend du niveau de résolution. Au niveau chromosomique, c'est la conservation des synténies (larges régions chromosomiques dont le contenu en gènes est identique dans les deux espèces) qui est pertinente alors qu'à un niveau élevé de résolution c'est la conservation des séquences, reflétée par la possibilité de les aligner, qui présente un intérêt. Le nombre de niveaux de conservation est fixé, de manière plus ou moins arbitraire à 5 pour les animaux et à 2 pour les autres règnes. Le logiciel Narcisse permet de naviguer entre ces niveaux de conservation.

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Licensing

Credits

INRA, CNRS and others...
Directeur de publication: Thomas Faraut
Administrateur: Emmanuel Courcelle

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"Narcisse: a mirror view of conserved syntenies
Emmanuel Courcelle; Yoann Beausse; Sebastien Letort; Olivier Stahl; Romain Fremez; Catherine Ngom-Bru; Jerome Gouzy; Thomas Faraut - Nucleic Acids Research 2008 Jan;36(Database issue):D485-90."
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